2024
Journal articles
- titre
- A Riemannian framework for incorporating white matter bundle priors in ODF-based tractography algorithms.
- auteur
- Thomas Durantel, Gabriel Girard, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Julie Coloigner
- article
- PLoS ONE, In press
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-
2023
Journal articles
- titre
- Editorial: Automatic methods for multiple sclerosis new lesions detection and segmentation
- auteur
- Olivier Commowick, Benoît Combès, Frédéric Cervenansky, Michel Dojat
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2023, 17, pp.1176625. ⟨10.3389/fnins.2023.1176625⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fnins.2023.1176625
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-
2022
Journal articles
- titre
- An iterative centroid approach for diffeomorphic online atlasing
- auteur
- Antoine Legouhy, François Rousseau, Christian Barillot, Olivier Commowick
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2022, 41 (9), pp.2521-2531. ⟨10.1109/tmi.2022.3166593⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/tmi.2022.3166593
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-
Conference papers
- titre
- Imaging biomarker discovery in major depressive disorder with diffusion MRI multi-compartment models
- auteur
- Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Julie Coloigner
- article
- OHBM 2022 - 28th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom
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-
- titre
- A convolutional Wasserstein distance for tractography evaluation : complementary study to state-of-the-art measures
- auteur
- Thomas Durantel, Julie Coloigner, Olivier Commowick
- article
- ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Calcutta, India. ⟨10.1109/ISBI52829.2022.9761650⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI52829.2022.9761650
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-
- titre
- Reproducibility and evolution of diffusion MRI measurements within the cervical spinal cord in multiple sclerosis
- auteur
- Haykel Snoussi, Benoit Combès, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Julien Cohen-Adad, Christian Barillot, Emmanuel Caruyer
- article
- ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Kolkata, India. pp.1-5
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-
Book sections
- titre
- L’imagerie cérébrale néonatale
- auteur
- François Rousseau, Olivier Commowick, Julien Jomier, Nicolas Passat, Fabrice Wallois
- article
- Le corps en images. Les nouvelles technologies d'imagerie pour la santé, pp.146-159, 2022, 978-2-271-14330-3
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-
Poster communications
- titre
- Imaging biomarker discovery in major depressive disorder with diffusion MRI multi-compartment models
- auteur
- Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Gabriel Robert, Julie Coloigner
- article
- OHBM 2022 - 28th Annual Meeting of the Organization of Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom. pp.1-1
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-
2021
Journal articles
- titre
- Multiple sclerosis lesions segmentation from multiple experts: The MICCAI 2016 challenge dataset
- auteur
- Olivier Commowick, Michaël Kain, Romain Casey, Roxana Ameli, Jean-Christophe Ferré, Anne Kerbrat, Thomas Tourdias, Frédéric Cervenansky, Sorina Camarasu-Pop, Tristan Glatard, Sandra Vukusic, Gilles Edan, Christian Barillot, Michel Dojat, Francois Cotton
- article
- NeuroImage, 2021, 244, pp.1-8. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118589⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2021.118589
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-
- titre
- A Clinically-Compatible Workflow for Computer-Aided Assessment of Brain Disease Activity in Multiple Sclerosis Patients
- auteur
- Benoît Combès, Anne Kerbrat, Guillaume Pasquier, Olivier Commowick, Brandon Le Bon, Francesca Galassi, Philippe L'Hostis, Nora El Graoui, Raphael Chouteau, Emmanuel Cordonnier, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferré
- article
- Frontiers in Medicine, 2021, 8, pp.1-14. ⟨10.3389/fmed.2021.740248⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmed.2021.740248
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-
- titre
- Aquaporin 4 distribution in the brain and its relevance for the radiological appearance of neuromyelitis optica spectrum disease
- auteur
- Roxana Ameli, Charles R.G. Guttmann, Juan Carlos Prieto, Fabien Rollot, Miklos Palotai, Sandra Vukusic, Romain Marignier, François Cotton, René Anxionnat, Jean-Paul Armspach, Bertrand Audoin, Christian Barillot, Isabelle Berry, Fabrice Bonneville, Claire Boutet, Giovanni Castelnovo, Frédéric Cervenanski, Mikael Cohen, Olivier Commowick, Jerome de Seze, Vincent Dousset, Francoise Durand-Dubief, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferré, Damien Galanaud, Tristan Glattard, Sylvie Grand, Justine Guillaumont, Rémy Guillevin, Salem Hannoun, Fabrice Heitz, Alexandre Krainik, Stéphane Kremer, Pierre Labauge, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Dominique Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Bruno Stankoff, Ayman Tourbah, Thomas Tourdias, Bruno Brochet, Michel Clanet, Nathalie Dufay, David Laplaud, Marie-Claire Maze, Thibault Moreau, Cédric Trolliet, Bernard Frangoulis, Javier Olaiz, Jean Pelletier, Bertrand Bourre, David Brassat, Philippe Cabre, Jean-Philippe Camdessanche, William Camu, Olivier Casez, Pierre Clavelou, Nicolas Collongues, Alain Creange, Gilles Defer, Marc Debouverie, Olivier Gout, Christine Lebrun-Frenay, Catherine Lubetzki, Caroline Papeix, Patrick Vermersch, Hélène Zephir
- article
- Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2021, 48 (3), pp.170-175. ⟨10.1016/j.neurad.2019.03.015⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neurad.2019.03.015
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-
- titre
- Multiparametric Analysis of Cerebral Development in Preterm Infants Using Magnetic Resonance Imaging
- auteur
- Marine Dubois, Antoine Legouhy, Isabelle Corouge, Olivier Commowick, Baptiste Morel, Patrick Pladys, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Maïa Proisy
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2021, 15, pp.1-19. ⟨10.3389/fnins.2021.658002⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fnins.2021.658002
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-
- titre
- Interpolation and averaging of diffusion MRI multi-compartment models
- auteur
- Renaud Hédouin, Christian Barillot, Olivier Commowick
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2021, 40 (3), pp.916-927. ⟨10.1109/tmi.2020.3042765⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/tmi.2020.3042765
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-
Conference papers
- titre
- MSSEG-2: Un challenge d'imagerie médicale sur VIP
- auteur
- Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Arthur Masson, Michael Kain, Michel Dojat, Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky
- article
- JCAD 2021, Dec 2021, En ligne, France
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-
- titre
- MSSEG-2: A medical imaging challenge on VIP
- auteur
- Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Arthur Masson, Michael Kain, Michel Dojat, Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky
- article
- EGI Conference 2021, Oct 2021, En ligne, France
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-
- titre
- Patient specific tracts-based analysis of diffusion compartment models: application to multiple sclerosis patients with acute optic neuritis
- auteur
- Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Charlotte Laurent, Jean-Christophe Ferré
- article
- ISMRM 2021 - International Society for Magnetic Resonance in Medicine, May 2021, Toronto, Canada. pp.1-6
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-
Proceedings
- titre
- MSSEG-2 challenge proceedings: Multiple sclerosis new lesions segmentation challenge using a data management and processing infrastructure
- auteur
- Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky, François Cotton, Michel Dojat
- article
- MICCAI 2021 - 24th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2021, Strasbourg, France. , pp.126, 2021
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-
2020
Journal articles
- titre
- New OFSEP recommendations for MRI assessment of multiple sclerosis patients: Special consideration for gadolinium deposition and frequent acquisitions
- auteur
- Stephane Kremer, Salem Hannoun, Fabrice Bonneville, Francoise Durand-Dubief, Thomas Tourdias, Christian Barillot, Charles Guttmann, Sandra Vukusic, Vincent Dousset, Francois Cotton, R. Ameli, René Anxionnat, Bertrand Audoin, Arnaud Attye, Elise Bannier, Douraied Ben Salem, Marie-Paule Boncoeur-Martel, Gildas Bonhomme, Claire Boutet, Jean-Christophe Brisset, Frédéric Cervenansky, Béatrice Claise, Olivier Commowick, Jean-Marc Constans, Pascal Dardel, Hubert Desal, Jean-Christophe Ferré, Alina Gaultier, E. Gerardin, T. Glattard, Sylvie Grand, T. Grenier, Rémy Guillevin, A. Krainik, S. Lion, Nicolas Menjot de Champfleur, Lydiane Mondot, Olivier Outteryck, Nadya Pyatigorskaya, Jean-Pierre Pruvo, Sylvain Rabaste, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Jean-Claude Sadik, Dominic Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Jean-Yves Tanguy, Ayman Tourbah, Bruno Brochet, Romain Casey, Jerome de Seze, Pascal Douek, F. Guillemin, David A. Laplaud, Christine Lebrun-Frenay, Lucilla Mansuy, Thibault Moreau, Javier Olaiz, Jean Pelletier, Claire Rigaud-Bully, Bruno Stankoff, Marc Debouverie, Gilles Edan, Jonathan Ciron, Catherine Lubetzki, Patrick Vermersch, Pierre Labauge, Gilles Defer, Eric Berger, Pierre Clavelou, O. Gout, Eric Thouvenot, Olivier Heinzlef, Abdullatif Al-Khedr, Bertrand Bourre, Olivier Casez, Philippe Cabre, Alexis Montcuquet, Alain Créange, Jean-Philippe Camdessanché, Serge Bakchine, A. Maurousset, Ivania Patry, Thomas de Broucker, Corinne Pottier, Jean-Philippe Neau, Céline Labeyrie, Chantal Nifle
- article
- Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2020, 47 (4), pp.250-258. ⟨10.1016/j.neurad.2020.01.083⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neurad.2020.01.083
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-
- titre
- Unsupervised Domain Adaptation With Optimal Transport in Multi-Site Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions From MRI Data
- auteur
- Antoine Ackaouy, Nicolas Courty, Emmanuel Vallée, Olivier Commowick, Christian Barillot, Francesca Galassi
- article
- Frontiers in Computational Neuroscience, 2020, 14, pp.1-13. ⟨10.3389/fncom.2020.00019⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fncom.2020.00019
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-
- titre
- Regional brain development analysis through registration using anisotropic similarity, a constrained affine transformation
- auteur
- Antoine Legouhy, Olivier Commowick, Maia Proisy, François Rousseau, Christian Barillot
- article
- PLoS ONE, 2020, 15 (2), pp.e0214174. ⟨10.1371/journal.pone.0214174⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0214174
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-
2019
Journal articles
- titre
- White matter abnormalities in depression: a categorical and phenotypic diffusion MRI study.
- auteur
- Julie Coloigner, Jean-Marie Batail, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Gabriel Robert, Christian Barillot, Dominique Drapier
- article
- Neuroimage-Clinical, 2019, 22, pp.101710. ⟨10.1016/j.nicl.2019.101710⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.nicl.2019.101710
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-
Conference papers
- titre
- Online atlasing using an iterative centroid
- auteur
- Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
- article
- MICCAI 2019 - 22nd International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2019, Shenzhen, China. pp.366-374, ⟨10.1007/978-3-030-32248-9_41⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-32248-9_41
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-
- titre
- Tissue microstructure information from T2 relaxometry and diffusion MRI can identify multiple sclerosis (MS) lesions undergoing blood-brain barrier breakdown (BBB)
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- article
- ISMRM 2019 - 27th Annual Meeting & Exhibition, May 2019, Montreal, Canada. pp.1-4
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-
- titre
- Unbiased longitudinal brain atlas creation using robust linear registration and log-Euclidean framework for diffeomorphisms
- auteur
- Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
- article
- ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venise, Italy. pp.1038-1041, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759508⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759508
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-
- titre
- Deep learning for multi-site ms lesions segmentation: two-step intensity standardization and generalized loss function
- auteur
- Francesca Galassi, Solène Tarride, Emmanuel Vallée, Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1
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-
- titre
- Geometric evaluation of distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
- auteur
- Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Julien Cohen-Adad, Olivier Commowick, Benoit Combes, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
- article
- ISBI 2019 - 16th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. pp.1696-1699, ⟨10.1109/ISBI.2019.8759196⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2019.8759196
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Compartments imaging for the characterization of brain diseases from quantitative MRI
- auteur
- Olivier Commowick
- article
- Neurons and Cognition [q-bio.NC]. Université de Rennes 1, France, 2019
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-
2018
Journal articles
- titre
- Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure
- auteur
- Olivier Commowick, Audrey Istace, Michael Kain, Baptiste Laurent, Florent Leray, Mathieu Simon, Sorina Camarasu Pop, Pascal Girard, Roxana Ameli, Jean-Christophe Ferré, Anne Kerbrat, Thomas Tourdias, Frédéric Cervenansky, Tristan Glatard, Jeremy Beaumont, Senan Doyle, Florence Forbes, Jesse Knight, April Khademi, Amirreza Mahbod, Chunliang Wang, Richard Mckinley, Franca Wagner, John Muschelli, Elizabeth Sweeney, Eloy Roura, Xavier Llado, Michel Santos, Wellington P Santos, Abel G Silva-Filho, Xavier Tomas-Fernandez, Hélène Urien, Isabelle Bloch, Sergi Valverde, Mariano Cabezas, Francisco Javier Vera-Olmos, Norberto Malpica, Charles R G Guttmann, Sandra Vukusic, Gilles Edan, Michel Dojat, Martin Styner, Simon K. Warfield, François Cotton, Christian Barillot
- article
- Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.13650. ⟨10.1038/s41598-018-31911-7⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-018-31911-7
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-
- titre
- USPIO-positive MS lesions are associated with greater tissue damage than gadolinium-positive-only lesions during 3-year follow-up
- auteur
- Anne Kerbrat, Benoît Combès, Olivier Commowick, Adil Maarouf, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Ayman Tourbah, Jean-Philippe Ranjeva, Christian Barillot, Gilles Edan
- article
- Multiple Sclerosis Journal, 2018, 24 (14), pp.1852-1861. ⟨10.1177/1352458517736148⟩
- DOI
- DOI : 10.1177/1352458517736148
- Accès au bibtex
-
- titre
- Measurement of pediatric regional cerebral blood flow from 6 months to 15 years of age in a clinical population
- auteur
- Aline Carsin-Vu, Isabelle Corouge, Olivier Commowick, Guillaume Bouzillé, Christian Barillot, Jean-Christophe Ferré, Maia Proisy
- article
- European Journal of Radiology, 2018, 101, pp.38-44. ⟨10.1016/j.ejrad.2018.02.003⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ejrad.2018.02.003
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-
Conference papers
- titre
- Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure
- auteur
- Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- JFR 2018 - Journées Françaises de Radiologie, Oct 2018, Paris, France. pp.1-19
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Bayes Hilbert Space for Compartment Model Computing in Diffusion MRI
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Alessandra Menafoglio, Simon K Warfield
- article
- MICCAI 2018 - International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2018, Grenade, Spain. pp.72-80, ⟨10.1007/978-3-030-00931-1_9⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-00931-1_9
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-
- titre
- Voxel-wise Comparison with a-contrario Analysis for Automated Segmentation of Multiple Sclerosis Lesions from Multimodal MRI
- auteur
- Francesca Galassi, Olivier Commowick, Emmanuel Vallee, Christian Barillot
- article
- MICCAI BrainLes 2018 workshop, Alessandro Crimi; Spyridon Bakas, Sep 2018, Granada, Spain. pp.180-188, ⟨10.1007/978-3-030-11723-8_18⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-11723-8_18
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-
- titre
- Identification of Gadolinium contrast enhanced regions in MS lesions using brain tissue microstructure information obtained from diffusion and T2 relaxometry MRI
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K Warfield, Christian Barillot
- article
- 21st International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2018), Sep 2018, Grenade, Spain. pp.63-71, ⟨10.1007/978-3-030-00931-1_8⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-00931-1_8
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-
- titre
- Anisotropic similarity, a constrained affine transformation: Application to brain development analysis
- auteur
- Antoine Legouhy, Olivier Commowick, François Rousseau, Christian Barillot
- article
- ISMRM 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Integration of Probabilistic Atlas and Graph Cuts for Automated Segmentation of Multiple Sclerosis lesions
- auteur
- Francesca Galassi, Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM 2018), Jun 2018, Paris, France. pp.1-6
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A 3-year follow-up study of enhancing and non-enhancing multiple sclerosis (MS) lesions in MS patients demonstrating clinically isolated syndrome (CIS) using a multi-compartment T2 relaxometry (MCT2) model
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Benoît Combès, Anne Kerbrat, Simon K Warfield, Christian Barillot
- article
- ISMRM Annual Meeting 2018, Jun 2018, Paris, France. pp.1-5
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi-Compartment Model of Brain Tissues from T2 Relaxometry MRI Using Gamma Distribution
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Simon K Warfield, Christian Barillot
- article
- ISBI 2018 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2018, Washington DC, United States. pp.141-144, ⟨10.1109/ISBI.2018.8363541⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2018.8363541
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- A three year follow-up study of gadolinium enhanced and non-enhanced regions in multiple sclerosis lesions using a multi-compartment T2 relaxometry model.
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Onur Afacan, Benoît Combès, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- article
- 2018
- DOI
- DOI : 10.1101/365379
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- Longitudinal multiple sclerosis lesion segmentation: Resource and challenge
- auteur
- Aaron Carass, Snehashis Roy, Amod Jog, Jennifer L. Cuzzocreo, Elizabeth Magrath, Adrian Gherman, Julia Button, James Nguyen, Ferran Prados, Carole H. Sudre, Manuel Jorge Cardoso, Niamh Cawley, Olga Ciccarelli, Claudia A.M. Wheeler-Kingshott, Sébastien Ourselin, Laurence Catanese, Hrishikesh Deshpande, Pierre Maurel, Olivier Commowick, Christian Barillot, Xavier Tomas-Fernandez, Simon K. Warfield, Suthirth Vaidya, Abhijith Chunduru, Ramanathan Muthuganapathy, Ganapathy Krishnamurthi, Andrew Jesson, Tal Arbel, Oskar Maier, Heinz Handels, Leonardo O. Iheme, Devrim Unay, Saurabh Jain, Diana M. Sima, Dirk Smeets, Mohsen Ghafoorian, Bram Platel, Ariel Birenbaum, Hayit Greenspan, Pierre-Louis Bazin, Peter A. Calabresi, Ciprian M. Crainiceanu, Lotta M. Ellingsen, Daniel S. Reich, Jerry L. Prince, Dzung L. Pham
- article
- NeuroImage, 2017, 148, pp.77 - 102. ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.12.064⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.12.064
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-
- titre
- Block-Matching Distortion Correction of Echo-Planar Images With Opposite Phase Encoding Directions
- auteur
- Renaud Hédouin, Olivier Commowick, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Maxime Taquet, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2017, 36 (5), pp.1106 - 1115. ⟨10.1109/TMI.2016.2646920⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2016.2646920
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-
Conference papers
- titre
- Comparison of inhomogeneity distortion correction methods in diffusion MRI of the spinal cord
- auteur
- Haykel Snoussi, Emmanuel Caruyer, Olivier Commowick, Elise Bannier, Anne Kerbrat, Christian Barillot
- article
- ESMRMB - 34th Annual Scientific Meeting European Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology, Oct 2017, Barcelone, Spain
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- L2 Similarity Metrics for Diffusion Multi-Compartment Model Images Registration
- auteur
- Olivier Commowick, Renaud Hédouin, Emmanuel Caruyer, Christian Barillot
- article
- 20th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention - MICCAI, Sep 2017, Québec, Canada. pp.257-265, ⟨10.1007/978-3-319-66182-7_30⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-66182-7_30
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-
- titre
- Multi-Compartment T2 Relaxometry Model Using Gamma Distribution Representations: A Framework for Quantitative Estimation of Brain Tissue Microstructures
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- article
- ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
- Accès au bibtex
-
- titre
- Gaining Insights Into Multiple Sclerosis Lesion Characteristics from Brain Tissue Microstructure Information: A Multi-Compartment T2 Relaxometry Approach
- auteur
- Sudhanya Chatterjee, Olivier Commowick, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- article
- ISMRM 25TH ANNUAL MEETING & EXHIBITION, Apr 2017, Honolulu, Hawaii, USA, United States
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Shanoir: Applying the Software as a Service Distribution Model to Manage Brain Imaging Research Repositories
- auteur
- Christian Barillot, Elise Bannier, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Anthony Baire, Ines Fackfack, Justine Guillaumont, Yao Yao, Michael Kain
- article
- Frontiers in information and communication technologies, 2016, MAPPING: MAnagement and Processing of Images for Population ImagiNG, ⟨10.3389/fict.2016.00025⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fict.2016.00025
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-
- titre
- Imaging biomarkers in Multiple Sclerosis: from image analysis to population imaging
- auteur
- Christian Barillot, Gilles Edan, Olivier Commowick
- article
- Medical Image Analysis, 2016, 33, pp.134-139. ⟨10.1016/j.media.2016.06.017⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2016.06.017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- A Bayesian Model to Assess T2 Values and Their Changes Over Time in Quantitative MRI
- auteur
- Benoit Combès, Anne Kerbrat, Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.570 - 578, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_66⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_66
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comprehensive Maximum Likelihood Estimation of Diffusion Compartment Models Towards Reliable Mapping of Brain Microstructure
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Simon K Warfield, Simone Vantini
- article
- 19th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2016, Athens, Greece. pp.622 - 630, ⟨10.1007/978-3-319-46726-9_72⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-46726-9_72
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-
- titre
- Automatic Multiple Sclerosis lesion segmentation from Intensity-Normalized multi-channel MRI
- auteur
- Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure - MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece
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-
- titre
- Multiple Sclerosis lesion segmentation using an automated multimodal Graph Cut
- auteur
- Jeremy Beaumont, Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- Proceedings of the 1st MICCAI Challenge on Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure – MICCAI-MSSEG, Oct 2016, Athens, Greece. pp.1-8
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-
- titre
- Maximum Likelihood Estimators of Brain White Matter Microstructure
- auteur
- Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Simone Vantini, Simon K. Warfield
- article
- 48th Scientific Meeting of the Italian Statistical Society, Jun 2016, Salerno, Italy
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-
Proceedings
- titre
- MSSEG Challenge Proceedings: Multiple Sclerosis Lesions Segmentation Challenge Using a Data Management and Processing Infrastructure
- auteur
- Olivier Commowick, Frédéric Cervenansky, Roxana Ameli
- article
- MICCAI, Oct 2016, Athènes, Greece. 2016
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-
2015
Journal articles
- titre
- The DTI Challenge: Toward Standardized Evaluation of Diffusion Tensor Imaging Tractography for Neurosurgery
- auteur
- Sonia Pujol, William Wells, Carlo Pierpaoli, Caroline Brun, James Gee, Guang Cheng, Baba Vemuri, Olivier Commowick, Sylvain Prima, Aymeric Stamm, Maged Goubran, Ali Khan, Terry Peters, Peter Neher, Klaus H Maier-Hein, Yundi Shi, Antonio Tristan-Vega, Gopalkrishna Veni, Ross Whitaker, Martin Styner, Carl-Fredrik Westin, Sylvain Gouttard, Isaiah Norton, Laurent Chauvin, Hatsuho Mamata, Guido Gerig, Arya Nabavi, Alexandra Golby, Ron Kikinis
- article
- Journal of Neuroimaging, 2015, pp.8. ⟨10.1111/jon.12283⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/jon.12283
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-
- titre
- CARMIN: a common web API for remote pipeline execution
- auteur
- Tristan Glatard, Yann Cointepas, Olivier Commowick, Michael Kain, Baptiste Laurent, Florent Leray, Christian Barillot
- article
- Frontiers in Neuroscience, 2015, 9, ⟨10.3389/conf.fnins.2015.91.00053⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/conf.fnins.2015.91.00053
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-
- titre
- Diffusion MRI abnormalities detection with orientation distribution functions: A multiple sclerosis longitudinal study
- auteur
- Olivier Commowick, Adil Maarouf, Jean-Christophe Ferré, Jean-Philippe Ranjeva, Gilles Edan, Christian Barillot
- article
- Medical Image Analysis, 2015, 22 (1), pp.114-123. ⟨10.1016/j.media.2015.02.005⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2015.02.005
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-
- titre
- OFSEP, a nationwide cohort of people with multiple sclerosis: Consensus minimal MRI protocol
- auteur
- Roxana Amélie, René Anxionnat, Jean-Paul Armspach, Bertrand Audoin, Christian Barillot, Isabelle Berry, Fabrice Bonneville, Claire Boutet, Giovanni Castelnovo, Frédéric Cervenansky, Mikael Cohen, Olivier Commowick, François Cotton, Jérôme de Seze, Vincent Dousset, Françoise Durand-Dubief, Gilles Edan, Jean-Christophe Ferre, Damien Galanaud, Tristan Glattard, Sylvie Grand, Justine Guillaumont, Rémy Guillevin, Charles Guttmann, Salem Hannoun, Fabrice Heitz, Alexandre Krainik, Stéphane Kremer, Pierre Labauge, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Philippe Ranjeva, Jean-Amédée Roch, Dominique Sappey-Marinier, Julien Savatovsky, Bruno Stankoff, Thomas Tourdias, Ayman Tourbah, Sandra Vukusic
- article
- Journal de Neuroradiologie / Journal of Neuroradiology, 2015, 42 (3), pp.133 - 140. ⟨10.1016/j.neurad.2014.12.001⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neurad.2014.12.001
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-
Conference papers
- titre
- Shanoir: Software as a Service Environment to Manage Population Imaging Research Repositories
- auteur
- Christian Barillot, Elise Bannier, Olivier Commowick, Isabelle Corouge, Justine Guillaumont, Yao Yao, Michael Kain
- article
- MICCAI Workshop on MAnagement and Processing of images for Population ImagiNG, Oct 2015, Munich, Germany. pp.23-30
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-
- titre
- Interpolation and Averaging of Multi-Compartment Model Images
- auteur
- Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Christian Barillot
- article
- 18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2015, Munich, Germany. pp.354-362, ⟨10.1007/978-3-319-24571-3_43⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-24571-3_43
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-
- titre
- Quantification of Myelin Degeneration in Multiple Sclerosis within Clinical Scan Times
- auteur
- Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
- article
- ISMRM, May 2015, Toronto, Canada
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-
- titre
- Results of a Phase 1b study to confirm safety and tolerability of olesoxime in multiple sclerosis patients
- auteur
- Jean Pelletier, Jean-Philippe Ranjeva, Ayman Tourbah, Gilles Edan, Christian Barillot, Sophie Le Lamer, Bertrand Audoin, Audrey Rico, Lydie Crespy, Ben Ridley, W Zaaraoui, Sylviane Confort-Gouny, Maxime Guye, Adil Maarouf, Nathalie Caucheteux, Marie-Pierre Chaunu, Christophe Portefaix, Laurent Pierot, Olivier Commowick, Anne Kerbrat, Laurence Catanese, Valerie Cuvier, Julien Veys, Rebecca Pruss, Wilfried Hauke
- article
- American Academy of Neurology, Apr 2015, Washington, DC, United States
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-
- titre
- Probabilistic One Class Learning for Automatic Detection of Multiple Sclerosis Lesions
- auteur
- Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, Brooklyn, United States. pp.486-489
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-
- titre
- Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
- auteur
- Renaud Hedouin, Olivier Commowick, Maxime Taquet, Elise Bannier, Benoit Scherrer, Simon K. Warfield, Christian Barillot
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), Apr 2015, New York, United States. pp.717-720
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-
- titre
- Automatic graph cut segmentation of multiple sclerosis lesions
- auteur
- Laurence Catanese, Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- ISBI Longitudinal Multiple Sclerosis Lesion Segmentation Challenge, Apr 2015, New York, United States
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-
- titre
- Quantification de la fraction d’eau piégée dans la myéline – Faisabilité et évaluation clinique en SEP
- auteur
- Lucas Soustelle, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
- article
- SFRMBM, Mar 2015, Grenoble, France
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-
- titre
- Robust Detection of Multiple Sclerosis Lesions from Intensity-Normalized Multi-Channel MRI
- auteur
- Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot
- article
- SPIE Medical Imaging, Feb 2015, Orlando, United States
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-
Patents
- titre
- Method of characterizing molecular diffusion within a body from a set of diffusionweighted magnetic resonance signals and apparatus for carrying out such a method
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
- article
- France, Patent n° : 069127 WO. 2015
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-
Poster communications
- titre
- Symmetric Block-Matching Registration for the Distortion Correction of Echo-Planar Images
- auteur
- Renaud Hédouin, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
- article
- ESMRMB, Oct 2015, Edimbourg, United Kingdom. 2015
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-
2014
Journal articles
- titre
- A Mathematical Framework for the Registration and Analysis of Multi-Fascicle Models for Population Studies of the Brain Microstructure
- auteur
- Maxime Taquet, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Jurriaan Peters, Mustafa Sahin, Benoît Macq, Simon K. Warfield
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2014, 33 (2), pp.504-517. ⟨10.1109/TMI.2013.2289381⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2013.2289381
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-
- titre
- Predictive Value of Imaging Markers at Multiple Sclerosis Disease Onset Based on Gadolinium- and USPIO-Enhanced MRI and Machine Learning
- auteur
- Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Adil Maarouf, Jean-Christophe Ferré, Elise Bannier, Ayman Tourbah, Isabelle Berry, Jean-Philippe Ranjeva, Gilles Edan, Christian Barillot
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (4), pp.e93024. ⟨10.1371/journal.pone.0093024⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0093024
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-
Conference papers
- titre
- Simultaneous Estimation of T1, T2 and B1 Maps From Relaxometry MR Sequences
- auteur
- Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Christian Barillot
- article
- MICCAI Workshop on Intelligent Imaging Linking MR Acquisition and Processing, Sep 2014, United States. pp.16-23
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-
- titre
- Tracking the Cortico-Spinal Tract as a Multi-Modal Distribution of Streamlines from Local White Matter Microstructure Models
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Jolene Singh, Simon K. Warfield
- article
- MICCAI Challenge on DTI Tractography Proceedings, Sep 2014, Boston, United States. pp.21-32
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-
- titre
- Longitudinal Intensity Normalization in Multiple Sclerosis Patients
- auteur
- Yogesh Karpate, Olivier Commowick, Christian Barillot, Gilles Edan
- article
- MICCAI Workshop on Clinical Image-based Procedures, Sep 2014, Boston, United States. pp.1-8
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-
- titre
- Analyse d'images spatio-temporelles dans la Sclérose en Plaques
- auteur
- Christian Barillot, Yogesh Karpate, Alessandro Crimi, Olivier Commowick
- article
- Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, Rouen, France
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-
- titre
- Non-central chi estimation of multi-compartment models improves model selection by reducing overfitting
- auteur
- Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Stefano Baraldo, Olivier Commowick, Simon K. Warfield
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2623
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-
- titre
- Fast and robust detection of the optimal number of fascicles in diffusion images using model averaging theory
- auteur
- Aymeric Stamm, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Christian Barillot, Simon K. Warfield
- article
- ISMRM, May 2014, Milan, Italy. pp.2629
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-
- titre
- Quantitative Relaxation Templates for the Human Brain at 3T
- auteur
- Fang Cao, Olivier Commowick, Camille Maumet, Christian Barillot
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.57-60
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fast Identification of Optimal Fascicle Configurations from Standard Clinical Diffusion MRI Using Akaike Information Criterion
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.238-241
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-
2013
Journal articles
- titre
- GPU & CPU implementation of Young - Van Vliet's Recursive Gaussian Smoothing Filter
- auteur
- Irina Vidal-Migallón, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Julien Dauguet, Tom Vercauteren
- article
- Insight Journal, 2013, pp.16
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-
Conference papers
- titre
- Tracking the Cortico-Spinal Tract from Low Spatial and Angular Resolution Diffusion MRI
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
- article
- MICCAI 2013 DTI Tractography Challenge on Peritumoral White Matter Anatomy for Neurosurgical Decision-Making, Sep 2013, Japan. pp.43-53
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-
- titre
- Statistical Analysis of White Matter Integrity for the Clinical Study of Specific Language Impairment in Children
- auteur
- Emmanuel Vallee, Olivier Commowick, Camille Maumet, Aymeric Stamm, Elisabeth Le Rumeur, Catherine Allaire, Jean-Christophe Ferré, Clément de Guibert, Christian Barillot
- article
- MICCAI 2013 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2013, Japan. pp.187-195, ⟨10.1007/978-3-319-02475-2_17⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-02475-2_17
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-
- titre
- Adaptive Multi-modal Particle Filtering for Probabilistic White Matter Tractography
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Christian Barillot, Patrick Pérez
- article
- Information Processing in Medical Imaging, Jul 2013, Monterey, United States. pp.594-606, ⟨10.1007/978-3-642-38868-2_50⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-38868-2_50
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-
- titre
- Using bilateral symmetry to improve non-local means denoising of MR brain images
- auteur
- Sylvain Prima, Olivier Commowick
- article
- 10th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro (ISBI'2013), Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1-8, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556703⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556703
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-
- titre
- Semi-Automatic Classification of Lesion Patterns in Patients with Clinically Isolated Syndrome
- auteur
- Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot
- article
- International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2013, San Francisco, United States. pp.1102-1105, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556671⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2013.6556671
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-
- titre
- Multiple Sclerosis Lesions Evolution in Patients with Clinically Isolated Syndrome
- auteur
- Alessandro Crimi, Olivier Commowick, Jean-Christophe Ferré, Adil Maarouf, Gilles Edan, Christian Barillot
- article
- SPIE Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, United States. pp.86690I-86690I-8
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-
- titre
- Multimodal rigid-body registration of 3D brain images using bilateral symmetry
- auteur
- Sylvain Prima, Olivier Commowick
- article
- Medical Imaging 2013: Image Processing, Feb 2013, Lake Buena Vista (Orlando Area), United States. pp.866911, ⟨10.1117/12.2007075⟩
- DOI
- DOI : 10.1117/12.2007075
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-
2012
Journal articles
- titre
- Estimating A Reference Standard Segmentation with Spatially Varying Performance Parameters: Local MAP STAPLE
- auteur
- Olivier Commowick, Alireza Akhondi-Asl, Simon K. Warfield
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2012, 31 (8), pp.1593-1606. ⟨10.1109/TMI.2012.2197406⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2012.2197406
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-
- titre
- Voxel-based quantitative analysis of brain images from F-18 Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography with a Block-Matching algorithm for spatial normalization
- auteur
- Christophe Person, Valérie Louis-Dorr, Sylvain Poussier, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Louis Maillard, Didier Wolf, Nicolas Gilet, Véronique Roch, Gilles Karcher, Pierre-Yves Marie
- article
- Clinical Nuclear Medicine, 2012, 37 (3), pp.268-273. ⟨10.1097/RLU.0b013e3182443b2d⟩
- DOI
- DOI : 10.1097/RLU.0b013e3182443b2d
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-
- titre
- Automated delineation of white matter fiber tracts with a multiple region-of-interest approach.
- auteur
- Ralph O. Suarez, Olivier Commowick, Sanjay P. Prabhu, Simon K. K. Warfield
- article
- NeuroImage, 2012, 59 (4), pp.3690-3700. ⟨10.1016/j.neuroimage.2011.11.043⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.neuroimage.2011.11.043
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-
Conference papers
- titre
- Registration and Analysis of White Matter Group Differences with a Multi-Fiber Model
- auteur
- Maxime Taquet, Benoit Scherrer, Olivier Commowick, Jurriaan Peters, Mustafa Sahin, Benoît Macq, Simon K. Warfield
- article
- 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.313-320
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-
- titre
- Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model: Part II
- auteur
- Aymeric Stamm, Olivier Commowick, Patrick Pérez, Christian Barillot
- article
- MICCAI 2012 DTI Tractography Challenge, Oct 2012, Nice, France. pp.12-20
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MRI Estimation of T1 Relaxation Time Using a Constrained Optimization Algorithm
- auteur
- Fang Cao, Olivier Commowick, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Gilles Edan, Christian Barillot
- article
- MBIA 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.203-214
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Automated diffeomorphic registration of anatomical structures with rigid parts: application to dynamic cervical MRI.
- auteur
- Olivier Commowick, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima
- article
- MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.163-70, ⟨10.1007/978-3-642-33418-4_21⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-33418-4_21
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-
- titre
- Non-local robust detection of DTI white matter differences with small databases.
- auteur
- Olivier Commowick, Aymeric Stamm
- article
- MICCAI 2012 - 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Oct 2012, Nice, France. pp.476-84, ⟨10.1007/978-3-642-33454-2_59⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-33454-2_59
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-
- titre
- Block-Matching Strategies for Rigid Registration of Multimodal Medical Images
- auteur
- Olivier Commowick, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima
- article
- 9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI'2012), May 2012, Barcelona, Spain. pp.700-703, ⟨10.1109/ISBI.2012.6235644⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2012.6235644
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2011
Journal articles
- titre
- Evaluation of registration methods on thoracic CT: the EMPIRE10 challenge.
- auteur
- Keelin Murphy, Bram van Ginneken, Joseph M. Reinhardt, Sven Kabus, Kai Ding, Xiang Deng, Kunlin Cao, Kaifang Du, Gary E. Christensen, Vincent Garcia, Tom Vercauteren, Nicholas Ayache, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Ben Glocker, Nikolaos Paragios, Nassir Navab, Vladlena Gorbunova, Jon Sporring, Marleen de Bruijne, Xiao Han, Mattias P. Heinrich, Julia A. Schnabel, Mark Jenkinson, Cristian Lorenz, Marc Modat, Jamie R. Mcclelland, Sébastien Ourselin, Sacha Ea Muenzing, Max A. Viergever, Dante de Nigris, Louis D. Collins, Tal Arbel, Marta Peroni, Rui Li, Gregory C. Sharp, Alexander Schmidt-Richberg, Jan Ehrhardt, René Werner, Dirk Smeets, Dirk Loeckx, Gang Song, Nicholas Tustison, Brian Avants, James C. Gee, Marius Staring, Stefan Klein, Berend C. Stoel, Martin Urschler, Manuel Werlberger, Jef Vandemeulebroucke, Simon Rit, David Sarrut, Josien Pw Pluim
- article
- IEEE Transactions on Medical Imaging, 2011, 30 (11), pp.1901-20. ⟨10.1109/TMI.2011.2158349⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/TMI.2011.2158349
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Comparison of 3 Diffusion Models to Track the Hand Motor Fibers within the Corticospinal Tract Using Functional, Anatomical and Diffusion MRI
- auteur
- Nicolas Wiest-Daesslé, Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Patrick Pérez, Christian Barillot, Romuald Seizeur, Sylvain Prima
- article
- MICCAI 2011 Workshop on Computational Diffusion MRI (CDMRI'11), Sep 2011, Toronto, Canada. pp.150-157
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multifiber Deterministic Streamline Tractography of the Corticospinal Tract Based on a New Diffusion Model
- auteur
- Olivier Commowick, Aymeric Stamm, Romuald Seizeur, Patrick Pérez, Christian Barillot, Sylvain Prima, Nicolas Wiest-Daesslé
- article
- MICCAI 2011 DTI Tractography Challenge Workshop, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.18-24
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Automated detection of white matter fiber bundles
- auteur
- Ralph Suarez, Olivier Commowick, Xavier Tomas-Fernandez, Sanjay Prabhu, Simon K. Warfield
- article
- IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2011, Apr 2011, Chicago, IL, United States. pp.845-848, ⟨10.1109/ISBI.2011.5872536⟩
- DOI
- DOI : 10.1109/ISBI.2011.5872536
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2010
Journal articles
- titre
- Outils de contourage, utilisation et construction d'atlas anatomiques : exemples des cancers de la tete et du cou
- auteur
- Liliane Ramus, Juliette Thariat, Pierre-Yves Marcy, Yoann Pointreau, Guillaume Bera, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- article
- Cancer/Radiothérapie, 2010, 14 (3), pp.206-12
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Construction of patient specific atlases from locally most similar anatomical pieces.
- auteur
- Liliane Ramus, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- article
- Med Image Comput Comput Assist Interv (MICCAI), Sep 2010, China. pp.155-162
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Incorporating priors on expert performance parameters for segmentation validation and label fusion: a maximum a posteriori STAPLE.
- auteur
- Olivier Commowick, Simon K Warfield
- article
- Med Image Comput Comput Assist Interv, Sep 2010, China. pp.25-32
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Robust and Efficient Block Matching Framework for Non Linear Registration of Thoracic CT Images
- auteur
- Vincent Garcia, Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- article
- Grand Challenges in Medical Image Analysis (MICCAI workshop), 2010, Beijing, China, China. pp.1-10
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2009
Journal articles
- titre
- A pre-clinical assessment of an atlas-based automatic segmentation tool for the head and neck
- auteur
- Richard Sims, Aurélie Isambert, Vincent Grégoire, François Bidault, Lydia Fresco, John Sage, John Mills, Jean Bourhis, Dimitri Lefkopoulos, Olivier Commowick, Mehdi Benkebil, Grégoire Malandain
- article
- Radiotherapy & Oncology, 2009, 93 (3), pp.474-8
- Accès au bibtex
-
- titre
- A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Linear Registration
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
- article
- Journal of Mathematical Imaging and Vision, 2009, 33 (2), pp.222-238. ⟨10.1007/s10851-008-0135-9⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s10851-008-0135-9
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Using Frankenstein's Creature Paradigm to Build a Patient Specific Atlas
- auteur
- Olivier Commowick, Simon K. K. Warfield, Grégoire Malandain
- article
- Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI'09), Part II, 2009, London, UK, United States. pp.993--1000, ⟨10.1007/978-3-642-04271-3_120⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-642-04271-3_120
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2008
Journal articles
- titre
- Atlas-Based Delineation of Lymph Node Levels in Head and Neck Computed Tomography Images
- auteur
- Olivier Commowick, Vincent Grégoire, Grégoire Malandain
- article
- Radiotherapy & Oncology, 2008, 87 (2), pp.281-289
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evaluation of an atlas-based automatic segmentation software for the delineation of brain organs at risk in a radiation therapy clinical context
- auteur
- Aurélie Isambert, Frédéric Dhermain, F. Bidault, Olivier Commowick, Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Dimitri Lefkopoulos
- article
- Radiotherapy & Oncology, 2008, 87 (1), pp.93-9. ⟨10.1016/j.radonc.2007.11.030⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.radonc.2007.11.030
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-
- titre
- An efficient locally affine framework for the smooth registration of anatomical structures
- auteur
- Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Aurélie Isambert, Jimena Costa, Frédéric Dhermain, F. Bidault, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
- article
- Medical Image Analysis, 2008, 12 (4), pp.427-41. ⟨10.1016/j.media.2008.01.002⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.media.2008.01.002
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-
Conference papers
- titre
- Detection of DTI white matter abnormalities in multiple sclerosis patients.
- auteur
- Olivier Commowick, Pierre Fillard, Olivier Clatz, Simon K Warfield
- article
- International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2008, New York City, United States. pp.975-82, ⟨10.1007/978-3-540-85988-8_116⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-540-85988-8_116
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-
2007
Conference papers
- titre
- Efficient Selection of the Most Similar Image in a Database for Critical Structures Segmentation
- auteur
- Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- article
- Proc. Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI'07), Part II, 2007, Brisbane, Australia, Australia. pp.203--210
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-
Theses
- titre
- Design and Use of Anatomical Atlases for Radiotherapy
- auteur
- Olivier Commowick
- article
- Interface homme-machine [cs.HC]. Université Nice Sophia Antipolis, 2007. Français. ⟨NNT : ⟩
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-
2006
Conference papers
- titre
- Statistics on Diffeomorphisms in a Log-Euclidean Framework
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- article
- 1st MICCAI Workshop on Mathematical Foundations of Computational Anatomy: Geometrical, Statistical and Registration Methods for Modeling Biological Shape Variability, Oct 2006, Copenhagen, Denmark. pp.14-15
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-
- titre
- A Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Rigid or Affine Registration
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- article
- Proceedings of the Third International Workshop on Biomedical Image Registration (WBIR'06), 2006, Utrecht, The Netherlands, Netherlands. pp.120-127, ⟨10.1007/11784012_15⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/11784012_15
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-
- titre
- Evaluation of Atlas Construction Strategies in the Context of Radiotherapy Planning
- auteur
- Olivier Commowick, Grégoire Malandain
- article
- Proceedings of the SA2PM Workshop (From Statistical Atlases to Personalized Models), 2006, Copenhagen, Denmark
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-
- titre
- A Log-Euclidean Framework for Statistics on Diffeomorphisms
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- article
- MICCAI 2006 - Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Part I, 2006, Copenhaguen, Denmark. pp.924--931, ⟨10.1007/11866565_113⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/11866565_113
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- titre
- An Efficient Locally Affine Framework for the Registration of Anatomical Structures
- auteur
- Olivier Commowick, Vincent Arsigny, Jimena Costa, Nicholas Ayache, Grégoire Malandain
- article
- Proceedings of the Third IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI 2006), 2006, Crystal Gateway Marriott, Arlington, Virginia, USA, United States. pp.478-481
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-
Reports
- titre
- A Fast and Log-Euclidean Polyaffine Framework for Locally Affine Registration
- auteur
- Vincent Arsigny, Olivier Commowick, Xavier Pennec, Nicholas Ayache
- article
- [Research Report] RR-5865, INRIA. 2006, pp.46
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-
2005
Journal articles
- titre
- Atlas-based automatic segmentation of MR images: validation study on the brainstem in radiotherapy context
- auteur
- Pierre-Yves Bondiau, Grégoire Malandain, Stéphane Chanalet, Pierre-Yves Marcy, Jean-Louis Habrand, François Fauchon, Philippe Paquis, Adel Courdi, Olivier Commowick, Isabelle Rutten, Nicholas Ayache
- article
- International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics, 2005, 61 (1), pp.289-98. ⟨10.1016/j.ijrobp.2004.08.055⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijrobp.2004.08.055
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-
Conference papers
- titre
- Incorporating statistical measures of anatomical variability in atlas-to-subject registration for conformal brain radiotherapy.
- auteur
- Olivier Commowick, Radu Stefanescu, Pierre Fillard, Vincent Arsigny, Nicholas Ayache, Xavier Pennec, Grégoire Malandain
- article
- Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention - MICCAI 2005, Oct 2005, Palm Springs, CA, United States. pp.927-34, ⟨10.1007/11566489_114⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/11566489_114
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2004
Conference papers
- titre
- Non-Rigid Atlas to Subject Registration with Pathologies for Conformal Brain Radiotherapy
- auteur
- Radu Stefanescu, Olivier Commowick, Grégoire Malandain, Pierre-Yves Bondiau, Nicholas Ayache, Xavier Pennec
- article
- MICCAI 2004 - 7th International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, Sep 2004, Saint-Malo, France. pp.704-711, ⟨10.1007/978-3-540-30135-6_86⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-540-30135-6_86
- Accès au texte intégral et bibtex
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